As aulas de cada disciplina são ministradas por meio da plataforma de ensino virtual MOODLE no período de quatro semanas de acordo com o calendário divulgado no site do CPAJ. A maioria dos professores utiliza seus próprios textos e estes são mesclados com textos, áudios e vídeos selecionados, seus ou de outrem. No mês de aulas, esses materiais ficam disponíveis ao aluno para acesso a qualquer hora. É o aluno quem deve administrar esse acesso de acordo com a sua disponibilidade de tempo e os prazos estabelecidos pelo professor. Para discussão, fixação do aprendizado e avaliação são utilizados fóruns, questionários e tarefas de dissertação sobre os temas abordados nas aulas.

As oito disciplinas de cada curso são oferecidas anualmente. As disciplinas são ministradas em módulos de quatro semanas, intercalados pelo espaço de uma semana entre eles, exceto nos meses de julho e dezembro, quando não há módulos. Cada módulo de disciplina equivale a 30 horas-aula, com o valor de 02 (dois) créditos. O curso pode ser integralizado em um ano. Serão oferecidas quatro disciplinas em cada semestre. O prazo máximo para a integralização de quaisquer dos cursos é de dois anos, contados a partir da matrícula no programa. Vencido esse prazo será necessária nova matrícula para retornar ao curso.