A segunda manifestação da Reforma Protestante ocorreu na Confederação Suíça, sob a liderança de Ulrico Zuínglio (Zurique) e João Calvino (Genebra). Desde o início, a Reforma Suíça ficou conhecida como “movimento reformado”, de onde provêm expressões como fé reformada, teologia reformada e tradição reformada. Com o passar dos anos, o líder mais destacado desse movimento veio a ser o francês João Calvino, cujo sistema doutrinário ficou conhecido como calvinismo. Os principais herdeiros do calvinismo desenvolveram uma forma de organização eclesiástica conhecida como presbiterianismo.